Se vc tem varias particoes no HD e' facil fazer isso, basta escolher
uma delas, de preferencia uma que comece e termine antes do cilindro 1024
(se nao me engano) confira as particoes e cilindros/setores com fdisk (ou 
cfdisk se for Debian). Tb escolha uma particao que nao seja a root, pois
dara' muito trabalho (se for uma particao so' para o /home, por exemplo,
vc pode transferir para outro local, mesmo que nao seja uma particao 
exclusiva, ao passo que a particao root / deve ter uma particao exclusiva
para ela, nao sei se me fiz entender).

Digamos esse disco:

# mount
/dev/hda1 on / type ext2 (rw)
/dev/hda2 on /home type ext2 (rw)
/dev/hda3 on /usr type ext2 (rw)
none on /proc type proc (rw)
  
sendo a /dev/hda4 a particao de swap.

Digamos que a particao /home seja a escolhida, o ideal seria joga'-la
na particao raiz em /dev/hda1, verifique com "df" se existe espaco
para isso, senao veja em /dev/hda3. Dai e' so'...

1 - copiar com "tar" para um diretorio /home.novo   (ou /usr/home)

    ( cd /home ; tar xf - . ) | ( cd /home.novo; tar xvf - )

2 - alterar os locais de montagem em /etc/fstab

3 - desmontar a particao atual do /home
  
    umount /home

4 - apagar o diretorio /home atual e ajustar o novo diretorio /home

    rmdir /home
    mv /home.novo /home          (ou   "ln -s usr/home /home" )
  
5 - se tudo correu bem, chamar o (c)fdisk e apagar a antiga particao
    do /home (/dev/hda2) e faze'-la ativa (o DOS e Win95, so' se 
    instalam em particoes ativas).

6 - bootar pelo DOS, etc. etc.

E' aconselhavel que tudo isso seja feito sem ninguem logado, exceto vc 
como root e sem programas rodando, como o XFree.